Lubānas mitraines kompleksa vides apsaimniekošanas plāna izstrādāšana (1999 - 2000)
Integrētais piekrastes zonas apsaimniekošanas plāns Baltijas valstīm un Polijai (1998 - 1999)
Sugu un biotopu projekts (Sugu un biotopu inventarizācija, aizsardzības plānu izstrāde un dabas aizsardzības struktūru attīstība Latvijā saistībā ar ES Putnu un Biotopu direktīvu transpozīciju) (1998 - 2000)
Bioloģiskās daudzveidības saglabāšanas pasākumi Latvijas agroainavā - atbalsta sistēma lēmumu pieņemšanai (1997 - 2000)
Lauku vides aizsardzības programma Centrāl- un Austrumeiropas valstīm(1997 - 2000)
Bioloģiskās daudzveidības stratēģija, rīcības programma un valsts ziņojums Konvencijas par bioloģisko daudzveidību dalībvalstu konferencei (1997 - 1999)
Vecdaugavas un Daugavgrīvas liegumu apsaimniekošana (1997)
Latvijas dabas daudzveidības apskats (1996 - 1997)
Teriologu konference (1996)
Bioloģiskās daudzveidības saglabāšana saistībā ar ilgtspējīgu lauksaimniecības attīstību Latvijā (1995 - 1996)
Integrētā piekrastes zonas apsaimniekošanas plāna izstrāde Engures-Ķemeru teritorijai (1995 - 1996)
Papes ezera un Jūrkalnes apsaimniekošanas projekts (1995 - 1998)
Dabas un kultūrainavu aizsardzības un apsaimniekošanas pilotprojekta izstrādāšana Jēkabpils rajonā (1995)
Vērtīgo un apdraudēto biotopu inventarizācija: dabisko un pusdabisko zālāju daļa (1995)
Latvijas vaskulāro augu floras datu bankas izveidošana (1995)
Nacionālās bioloģiskās daudzveidības rīcības programmas Latvijai sagatavošana (1995)
Latvijas purvu inventarizācija un izvērtēšana (1995 - 1996)
Latvijas Sikspārņu fauna (1995 - 1996)
Pļavu projekti: Jēkabpils raj. (1995) Gaujas Nacionālajā parkā (1995 - 1996)
CORINE Biotopi (Koordinētie vides dati) (1994 - 1997)
Latvijas lielāko bijušo militāro poligonu dabas vērtību izpēte (1994 - 1995)
Aizsargājamo teritoriju dibināšana melnajam stārķim un citām jutīgām sugām Latvijas mežos (1994 - 1997)
No VIDM budžeta finansēti sekojošie dabas aizsardzības projekti:
Aizsargājamo dabas teritoriju aizsardzības plānu izstrāde (1998)
Aizsargājamo augu atradņu inventarizācija (1997 - 1998)
Latvijas mežu daudzveidības novērtējums un aizsargājamo mežu īpatsvara pamatojums (1996 - 1998)
Aizsargājamo dabas teritoriju platību noteikšana uz kartes (1998)
Engures ezera dabas parka apsaimniekošana (1998)
Latvijas vides aizsardzības popularizēšana Latvijā (1998)
Dabas aizsardzības normatīvo aktu izstrāde (1998)
Aizsargājamo teritoriju apsaimniekošanas plānu izstrāde (1996 - 1997)
Engures lieguma apsaimniekošana (1996 - 1997)
Īpaši aizsargājamo dabas teritoriju kartogrāfija (1997)
Latvijas pamatkartes mērogā 1:50000 datu bāzes daļu, kura ietver Ķemeru Nacionālā parka teritoriju sagatavošana (1996)
Īpaši aizsargājamo dabas teritoriju "Piejūras dabas parks" (dienvidu daļas) un "Kraukļa kalna iezis - smilšakmens atsegums" kartogrāfiskā materiāla izgatavošana (1996)
Īpaši aizsargājamo dabas teritoriju kartogrāfiskā materiāla sagatavošana (1996)
Aizsargājamo augu un dzīvnieku atradņu inventarizācija (1995 - 1996)
Aizsargājamo augu un dzīvnieku atradņu inventarizācija ārpus aizsargājamajām teritorijām (1995)
Aizsargājamo teritoriju tīkla optimizēšana (Latvijas mežu daudzveidības novērtējums) (1995)
Eiropas dabas aizsardzības gada pasākumi (1995)
Engures dabas lieguma kompleksais monitorings (1995)